导致尖锐湿疣复发的因素很多
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专家指出：导致尖锐湿疣复发的因素很多，主要涉及以下几个方面：
一、对于病人来说，感染HPV可能存在3种不同的状态，即对肉眼可见向外生长的疣组织，肉眼不能见，只能在显微镜下才能见到的有病变的亚临床感染，尚未出现病变、但组织表面携带有病毒，只能用分子杂交技术如PCR才能检测出病毒，临床医生只注重治疗长出的疣体，忽视了亚临床感染期的治疗，以及潜伏期的治疗。
二、忽视了尖锐湿疣患者存在混合感染的现象，治疗上只重视对尖锐湿疣作处理而未治疗其它的感染。临床上常见的尖锐湿疣与淋病混合感染，女性患者常合并有滴虫、霉菌性阴道炎，亦有梅毒合并尖锐湿疣者。因此在治疗尖锐湿疣时，应考虑先治、后治或同时治疗的问题。
三、鉴于目前尖锐湿疣治疗方案上的混乱，以及一些不可靠的治疗方法，药物的效果不完美，大部分无经验、以及非专业医生混岗导致治疗上的不有效，产生复发。
四、再感染，夫妻一方治好了，而另一方却是亚临床感染或病毒携带者，通过性生活又可被传染，形成乒乓球式的传染，导致反反复复。
五、尖锐湿疣的病变过程发生在上皮组织内，病毒也只局限于上皮组织层内，人体皮肤粘膜的免疫细胞存在于上皮下的真皮层内，由于上皮组织的基底层的阻隔;真皮内免疫系统不能与表皮内HPV病毒颗粒接触而建立有效的免疫应答反应，因而使得不少尖锐湿疣久治不愈。
六、个别病人，生活不检点，性关系长期混乱，导致反复感染。
七、保持外阴、肛周清洁、干燥，减少阴部及肛周的潮湿环境，可降0尖锐湿疣的复发率，还能阻止感染尖锐湿疣病毒。
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